20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2054 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.07 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.62 
 
 
351 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  25.18 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  41.18 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  25.83 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  36.27 
 
 
105 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  41.38 
 
 
104 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  44.26 
 
 
105 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  41.38 
 
 
105 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  41.38 
 
 
105 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  39.39 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  39.39 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.86 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  38.1 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  39.39 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  39.39 
 
 
107 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  39.39 
 
 
107 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  39.39 
 
 
107 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>