56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2001 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  100 
 
 		 107 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  100 
 
 		 107 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  100 
 
 		 107 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  99.07 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  99.07 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  97.2 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  95.33 
 
 		 109 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  95.33 
 
 		 107 aa  196  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  95.33 
 
 		 107 aa  196  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 109 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 109 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  83.18 
 
 		 107 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  77.57 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  43.14 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  43.14 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  36.89 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  33.64 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  33.64 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  32.63 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.48 
 
 		 241 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0505  lipoprotein  29.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  39.39 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  37.31 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  36.05 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5263  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 110 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  28.99 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  28.99 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  31.46 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  35.37 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  36.05 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  36.51 
 
 		 125 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  29.79 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  36.59 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  36.59 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1373  hypothetical protein  29 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  36.59 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  38.55 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  40.35 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2709  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>