44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1896 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  100 
 
 		 107 aa  226  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  99.07 
 
 		 109 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  99.07 
 
 		 107 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  99.07 
 
 		 107 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  99.07 
 
 		 109 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  85.98 
 
 		 109 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  84.11 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  83.18 
 
 		 107 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  83.18 
 
 		 107 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  83.18 
 
 		 107 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  82.24 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  73.83 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  82.24 
 
 		 109 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  82.24 
 
 		 109 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  39.62 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  40.22 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  37.1 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  38.1 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  34.07 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  38.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  27.94 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  27.94 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  28.43 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  32.93 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  32.93 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  32.93 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.68 
 
 		 325 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>