21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2941 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  270  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  34.88 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  41.07 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  28.89 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  28.89 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  35.71 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  28.24 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  32.29 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  34.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  34.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  25.42 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1398  Protein of unknown function DUF2091, periplasmic  31.63 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  33.33 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>