41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2217 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  100 
 
 
100 aa  206  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  54.9 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  54.9 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  54.9 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  52.94 
 
 
105 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  50.49 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  46.46 
 
 
98 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  45.54 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  36.54 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  40.38 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  38.46 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  38.46 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  38.46 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  38.46 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  30.56 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1398  Protein of unknown function DUF2091, periplasmic  30.85 
 
 
149 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  30.58 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  38.1 
 
 
236 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  28.05 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  36.51 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  36.51 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  36.51 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  27.38 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  27.38 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  27.38 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  27.38 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  27.38 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  27.38 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  27.38 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.11 
 
 
325 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  28.21 
 
 
151 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>