40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1247 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  254  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  90.98 
 
 
122 aa  230  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  70.1 
 
 
126 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  56.41 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  51.22 
 
 
127 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  55.34 
 
 
126 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  55.34 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  55.88 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  55.88 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  55.34 
 
 
126 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  55.34 
 
 
126 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  36.17 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.5 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  37.78 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  37.78 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  34.44 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  46.38 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  46.38 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  37.74 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  39.73 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  34.17 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  34.17 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  39.73 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  30.58 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  43.14 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1352  lysozyme inhibitor  30.86 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0256703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1367  lysozyme inhibitor  30.86 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1336  lysozyme inhibitor  30.86 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597264  normal  0.131333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2117  lysozyme inhibitor  30.86 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1933  lysozyme inhibitor  30.86 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.30737  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  28.32 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  29.76 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>