48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2556 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  100 
 
 		 105 aa  221  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  100 
 
 		 105 aa  221  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  219  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  54.9 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  52.38 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  50.98 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  51.65 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  44.12 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  44.12 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  44.12 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  44.12 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  44.12 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  42.16 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  42.7 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  42.7 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  42.7 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  42.7 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  42.7 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  42.7 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  42.05 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  43.18 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  43.18 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  34.17 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  34.55 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1796  hypothetical protein  29.7 
 
 		 228 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.207584  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  34.09 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  29.17 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  32.05 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  30.28 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  28.12 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  30.28 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  28.12 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  41.38 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  36.92 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  31.71 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  32.26 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  32.26 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  26.61 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  26.61 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  41.67 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  40.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1519  hypothetical protein  34.57 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792708  normal  0.408209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  30.23 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.65 
 
 		 325 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>