50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4650 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  100 
 
 
127 aa  258  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  100 
 
 
127 aa  258  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  50.65 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.01 
 
 
241 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  47.87 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  45.74 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  45.74 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  48.05 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  48.05 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  43.88 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  43.28 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  45.83 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  45.83 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  45.83 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  45.83 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  45.83 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  46.38 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  45.83 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  45.83 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  44.93 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  42.35 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  42.35 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  42.35 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  38.54 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  47.62 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  37.5 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  40 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  40 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  32.48 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  38.57 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  38.57 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  38.57 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  38.57 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  38.57 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  38.57 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  39.13 
 
 
107 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  39.13 
 
 
107 aa  48.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  30.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  30 
 
 
122 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  30.28 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  40.3 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  30.28 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  30.28 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  28.89 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>