35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2356 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  97.42 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  71.81 
 
 		 151 aa  229  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  48.05 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  48.05 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  45.59 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50 
 
 		 241 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  37.78 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  36.73 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  40.79 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  44.16 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  39.08 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  39.08 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  39.08 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  35.29 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  36.59 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  34.12 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  37.04 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  34.12 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  37.04 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  34.12 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  37.14 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  30.86 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  40.48 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  40.48 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  40.48 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>