29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0084 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  43.75 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  48.98 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  47.83 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  47.83 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  37.14 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  45.1 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  47.83 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  35.71 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  45.65 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  44 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  42 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  43.1 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.64 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  42 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  43.1 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  45.83 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  45.83 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  43.75 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  43.75 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  45.83 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  43.75 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  41.3 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  54.84 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>