37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2356 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  99.21 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  81.89 
 
 		 127 aa  220  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  86.4 
 
 		 126 aa  216  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  86.4 
 
 		 126 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  86.4 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  86.4 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  68 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  64.57 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  64.57 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  64.57 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  64.57 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  64.57 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  64.57 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  64.57 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  55.34 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  53.57 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  44.88 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  42.68 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  37.5 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  35.29 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.5 
 
 		 241 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  43.1 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  27.62 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  36.05 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  36.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  27.78 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  36.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  27.78 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  36.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  26.02 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>