29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0413 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  54.92 
 
 		 197 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  53.01 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  52.41 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  52.35 
 
 		 180 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  51.22 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  50.6 
 
 		 171 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  52.53 
 
 		 164 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  49.08 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  51.52 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  51.2 
 
 		 172 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  49.7 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  46.95 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  48.43 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  44.19 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  40.32 
 
 		 177 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  44.44 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  43.67 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  40.61 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  46.31 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  44.97 
 
 		 154 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  44.97 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  29.35 
 
 		 119 aa  41.2  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>