29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5284 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  58.44 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  57.32 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  57.32 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  56.79 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  52.2 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  52.53 
 
 		 198 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  54.55 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  49.37 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  47.44 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  49.32 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  51.27 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  45.73 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.5 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  45.91 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  46.25 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  42.58 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  42.5 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  42.5 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  45.95 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  46.05 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  46.05 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  38.65 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  93.6  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  33.87 
 
 		 147 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>