27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2653 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  100 
 
 		 174 aa  342  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  50.86 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  51.16 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  53.42 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  51.28 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  49.4 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  49.42 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  47.88 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  44.38 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  49.09 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  45.35 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  49.33 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  48.12 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  44.77 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  48.05 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  45.93 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  46.41 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  46.06 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  45.75 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  49.64 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  37.71 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  43.38 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  43.38 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  36 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>