27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1308 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  91.16 
 
 		 181 aa  345  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  62.13 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  57.32 
 
 		 164 aa  184  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  54.88 
 
 		 197 aa  183  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  52.41 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  47.8 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  43.48 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  43.6 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  43.6 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  45.1 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  43.9 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  43.53 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  41.82 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  45.81 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  49.63 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  43.64 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.76 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  42.21 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  39.62 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  41.79 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>