27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2571 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  49.04 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  50.98 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  44.91 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  43.27 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  42.51 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  46.71 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  43.9 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  46.34 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  44.24 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  50 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  48.05 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  44.44 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  42.5 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  43.03 
 
 		 181 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  43.64 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  37.22 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.42 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  35.76 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  47.86 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  40.15 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  40.15 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>