27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0958 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  73.26 
 
 		 177 aa  273  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  69.77 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  55.28 
 
 		 200 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  48.8 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  49.4 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  46.25 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  45.45 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.72 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  45.68 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  44.25 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  42.51 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  41.88 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  45.91 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  43.98 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  46.95 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  43.9 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  43.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  40.8 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  42.68 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  45.95 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  42.42 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>