29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4057 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  99.35 
 
 		 154 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  55.1 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  53.73 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  52.27 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  46.05 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  47.65 
 
 		 197 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  43.62 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  42.07 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  43.62 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  43.38 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  43.36 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  40.15 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  46.61 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  40.3 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  41.79 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  43.38 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  40.43 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.86 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 173 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  41.35 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  35.04 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  29.46 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>