34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1962 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  36.71 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  51.41 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  47.3 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  46.62 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  45.95 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  47.18 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  45.86 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  46.48 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  44.9 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  47.3 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  47.3 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  41.84 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  41.84 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  45.14 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  39.19 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  29.94 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  39.44 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  26.38 
 
 		 599 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  25.48 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  27.11 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  31.25 
 
 		 612 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  27.27 
 
 		 1156 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1974  Mu-like prophage major head subunit gpT  44.83 
 
 		 61 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  27.27 
 
 		 651 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  27.27 
 
 		 651 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  28.34 
 
 		 641 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  25.26 
 
 		 687 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  27.07 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  24.56 
 
 		 586 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  26.49 
 
 		 689 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  28.87 
 
 		 656 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 154 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>