14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1599 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2127  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.67 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.55 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 135 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  27.78 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1202  cupin 2, barrel  31.13 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  23.76 
 
 		 107 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 104 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>