22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0494 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  336  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.03 
 
 
168 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.77 
 
 
164 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.03 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.97 
 
 
240 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.57 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.97 
 
 
240 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  36.92 
 
 
240 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  31.08 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1436  hypothetical protein  32.14 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  35.07 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  32.28 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  30.53 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  26.83 
 
 
145 aa  47.8  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1942  hypothetical protein  28.87 
 
 
254 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.87 
 
 
254 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.07 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  34.13 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  29.13 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.38 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2577  hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.86 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0415221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1199  hypothetical protein  30.61 
 
 
226 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>