39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3817 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  98.98 
 
 		 294 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  61.32 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  60.48 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  37.01 
 
 		 561 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  40.67 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  38.7 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  39.39 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  46.53 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  38.66 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  41.22 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  43.02 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  37.5 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  39.86 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  46.03 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  41.73 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  46.3 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  48.15 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  48.15 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  37.29 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.8 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  37.01 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  34.82 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  38.26 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  31.06 
 
 		 395 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3503  hypothetical protein  49.28 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186564  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  32.19 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  26.14 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  39.06 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  40.35 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  24.32 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  36.92 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  22.7 
 
 		 183 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  35.17 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>