23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2857 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  38.13 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  36.54 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  36.22 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  38.75 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  33.44 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  27.71 
 
 		 561 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2274  hypothetical protein  29.67 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  35.85 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  32.82 
 
 		 495 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  33.75 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7022  hypothetical protein  38.02 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.00000183112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4145  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000490948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  36.75 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.13 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.44 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  31.53 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  29.84 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  30.65 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  29.46 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  30.69 
 
 		 568 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  24.15 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>