39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2012 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  80.78 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  80.57 
 
 		 284 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  47.76 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  33.67 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  34.15 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  31.43 
 
 		 280 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  31.7 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  32.23 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  30.36 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  32.89 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  37 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  27.4 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  41.84 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0250  hypothetical protein  32.87 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  36.11 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  30.53 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0276  hypothetical protein  30.97 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  37 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  31.5 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2013  hypothetical protein  30.34 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  29.91 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  34.68 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  37.17 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  26.25 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  34.68 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  35.4 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  29.2 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  23.26 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  31.62 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  37.23 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  32.56 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  32.74 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  38.57 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.2 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  23.6 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  36.92 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>