27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4129 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  42.55 
 
 
311 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  42.67 
 
 
312 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  34.75 
 
 
324 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  35.56 
 
 
304 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  44.07 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  43.8 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  38.28 
 
 
280 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  39.17 
 
 
266 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  41.38 
 
 
119 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  37 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  35.35 
 
 
130 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  35.71 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  36.44 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  36 
 
 
282 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  34 
 
 
288 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  36.78 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  34.75 
 
 
131 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  29.41 
 
 
111 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  25.51 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  25.51 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  25.51 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  35.71 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  38.75 
 
 
201 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  39.44 
 
 
140 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  38.75 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>