44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3366 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  52.75 
 
 
311 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  49.03 
 
 
312 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  51.22 
 
 
266 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  51.95 
 
 
324 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  50.5 
 
 
304 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  48.95 
 
 
281 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  48.41 
 
 
280 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  40.88 
 
 
233 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  34.46 
 
 
284 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  33.78 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  46.15 
 
 
119 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 
282 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  41.26 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  39.86 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  40.74 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  38.1 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  34.57 
 
 
111 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  28.84 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  33.63 
 
 
152 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  32.41 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  40.4 
 
 
142 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  34.45 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  36.19 
 
 
123 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  36.27 
 
 
130 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  36.7 
 
 
243 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  39.29 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  31.4 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  32.95 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  27.08 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  30.07 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  30.07 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  30.07 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1879  hypothetical protein  37.5 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1658  hypothetical protein  30.48 
 
 
181 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.336581  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  31 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4686  hypothetical protein  34.33 
 
 
166 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  30.95 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  29.82 
 
 
118 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  30.93 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  32.67 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>