35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1132 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  307  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  88.89 
 
 
131 aa  234  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  55.93 
 
 
123 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  52.03 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  49.26 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  41.96 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3797  hypothetical protein  39.1 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  31.78 
 
 
258 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  38.14 
 
 
304 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  32.29 
 
 
261 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  34.92 
 
 
312 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  32.29 
 
 
261 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  32.29 
 
 
261 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  34.38 
 
 
243 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  32.08 
 
 
253 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  36.44 
 
 
233 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  31.34 
 
 
248 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  33.93 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  33.63 
 
 
292 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  41.03 
 
 
269 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  43.59 
 
 
268 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  36.84 
 
 
272 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  37.66 
 
 
261 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  36.84 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  28.87 
 
 
259 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  28.87 
 
 
259 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  26.36 
 
 
249 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  29.35 
 
 
277 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  29.35 
 
 
277 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  29.47 
 
 
324 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  25.53 
 
 
279 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  35.24 
 
 
292 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  32.63 
 
 
280 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>