38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  67.86 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  55.93 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  52.54 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  53.85 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3797  hypothetical protein  37.36 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  35.35 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  32.71 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  30.48 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  43.21 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  27.78 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  35.35 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  26.85 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  28.71 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  42.86 
 
 		 312 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  29.59 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  30.19 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  36.19 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  42.11 
 
 		 311 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  32.08 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  28.16 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  37.66 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  28.97 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0576  hypothetical protein  50.91 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  31.17 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  27.55 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  36.62 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  33.7 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  26.13 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>