34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0924 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  55.65 
 
 
280 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  52.94 
 
 
281 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  50.86 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  48.7 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  44.63 
 
 
304 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  46.15 
 
 
292 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  41.38 
 
 
233 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  36.75 
 
 
266 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  41.84 
 
 
282 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  38.78 
 
 
282 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  40.7 
 
 
284 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  40.26 
 
 
288 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  41.18 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.73 
 
 
307 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  31.11 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  33.72 
 
 
248 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  31.33 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  29.57 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  32.26 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  23.66 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  32.79 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  34.15 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  29.76 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  30.19 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  37.93 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  31.46 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  33.7 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>