39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5718 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  41.76 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  30.3 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  39.39 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  32.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  32.86 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  38.98 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  34.41 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  32.29 
 
 		 400 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  34.38 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  40.35 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  37.1 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  35.16 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  32.1 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  32.47 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  29.55 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  32.47 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  37.29 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  28.41 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  34.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  28.24 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  28.26 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  37.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  28.4 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  37.29 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 		 526 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  46.3 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  37.1 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  30.93 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  28.12 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  23.66 
 
 		 119 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  33.8 
 
 		 141 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  32.94 
 
 		 163 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  36.07 
 
 		 212 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>