163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0542 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
201 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  98.51 
 
 
201 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  55.08 
 
 
212 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  55.83 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  39.84 
 
 
172 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  42.24 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  38.84 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  41.49 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  38.76 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  33.33 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  50.85 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  35.45 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  44.87 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  39.32 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  40.78 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  41.98 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  40.79 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  38.68 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  38.96 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  40.26 
 
 
115 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  36.99 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  40.82 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  38.21 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  39.8 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  39.51 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  43.21 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  43.21 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  43.21 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  35.64 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  41.98 
 
 
142 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  39.78 
 
 
142 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  38.82 
 
 
147 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  41.98 
 
 
142 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  41.1 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  38.1 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  40.48 
 
 
142 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  36.67 
 
 
143 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 
135 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  39.53 
 
 
140 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  37.08 
 
 
134 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  37.21 
 
 
140 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  37.21 
 
 
143 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  40.68 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  32.56 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  40.68 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  39.08 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  35.56 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  33.06 
 
 
214 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  34.62 
 
 
300 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
122 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  35.11 
 
 
129 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  33.06 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  36.63 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  35.4 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  31.46 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  38.89 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  31.87 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  37.78 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  35.96 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  32.63 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  33.72 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  32.94 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  38.83 
 
 
134 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  29.63 
 
 
157 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  30.68 
 
 
260 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  34.44 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  31.4 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  34.44 
 
 
160 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  37.8 
 
 
137 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  34.44 
 
 
161 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  36.25 
 
 
98 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  33.33 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  34.44 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  29.63 
 
 
293 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  34.44 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  35.92 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  37.04 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  33.64 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  35.56 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  32.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  35.54 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  34.41 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  34.44 
 
 
166 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.37 
 
 
133 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  36.78 
 
 
163 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  28.91 
 
 
140 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  31.11 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  31.82 
 
 
117 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  27.55 
 
 
526 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  31.11 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  31.11 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  35.9 
 
 
119 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  32.86 
 
 
485 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2061  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  32 
 
 
130 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>