161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0390 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1053    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  53.24 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  47.42 
 
 		 122 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  44.08 
 
 		 158 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  45.74 
 
 		 158 aa  93.6  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  43.62 
 
 		 183 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  43.62 
 
 		 156 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  43.62 
 
 		 156 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  35.83 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  37.96 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  43 
 
 		 171 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  52.44 
 
 		 84 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  37.89 
 
 		 175 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  42.11 
 
 		 157 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  41 
 
 		 120 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  44.83 
 
 		 140 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  43.01 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  37.89 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  38.3 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 160 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 160 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  39.36 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  37.89 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  37.89 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  37.89 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  35.79 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  35.79 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  35.92 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  44.05 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  35.51 
 
 		 122 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  34.95 
 
 		 120 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  34.95 
 
 		 120 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  36.96 
 
 		 119 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 118 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  34.34 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  34.34 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  32.97 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  34.34 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  34.34 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  34.29 
 
 		 117 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  35.96 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  35.96 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  31.31 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  32.41 
 
 		 139 aa  67  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  32.73 
 
 		 117 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  35.96 
 
 		 145 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  35.96 
 
 		 145 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  40.58 
 
 		 117 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  29.46 
 
 		 133 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  34.41 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  34.83 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  34.94 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  31.58 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  29.1 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  30.85 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  28.93 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  33.73 
 
 		 131 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  38.37 
 
 		 172 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 		 112 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  32.32 
 
 		 130 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  30.53 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  39.39 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  33.71 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  33.03 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  33.03 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  29.9 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  42.65 
 
 		 119 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  25 
 
 		 129 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  32.22 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  34.83 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  50 
 
 		 120 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  46 
 
 		 147 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  48 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  38.81 
 
 		 147 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  31.4 
 
 		 122 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  43.1 
 
 		 63 aa  53.5  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  42.37 
 
 		 99 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  44.26 
 
 		 111 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  45.76 
 
 		 99 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  45.76 
 
 		 99 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  30.07 
 
 		 133 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  31.4 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  39.66 
 
 		 169 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  40.32 
 
 		 120 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  40.68 
 
 		 187 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  27.92 
 
 		 145 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  30.23 
 
 		 122 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>