151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1321 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  91.79 
 
 		 134 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  70.91 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  64.29 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  52.81 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  46.88 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  45.74 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  46.59 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  44.53 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  42.31 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  39.2 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  39.2 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  39.2 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  39.2 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  36.11 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  40.2 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  30.23 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  43.42 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  38.52 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  35.94 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  38.28 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  39.51 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  39.51 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  31.71 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  37.5 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  38.37 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  35.24 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  33.01 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  35.24 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  39.24 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  38.27 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  39.78 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  39.06 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  37.8 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  36.84 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  36.59 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  37.86 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  34.15 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.97 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  51.92 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  35.8 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  36.89 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  36.9 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  37.04 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  37.25 
 
 		 400 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  34.83 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  34.57 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  32.21 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  33.88 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  28.35 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  33.88 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  39.39 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  32.1 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  38.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  32.22 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  39.68 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  30.86 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  39.02 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  44.26 
 
 		 389 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  34.75 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  36.51 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  32.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  27.91 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  32.65 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  32.1 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  30.86 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  37.8 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  37.8 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  36.9 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 485 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.77 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  32.46 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>