97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4133 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  95.8 
 
 		 143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  54.76 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  52.55 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  52.55 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  53.17 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  52.8 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  51.2 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  52 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  52 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  52 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  40.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  44.04 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  52.83 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  45.95 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  42.86 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  42.86 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  46.23 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  44.64 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  49.33 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  44.53 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  43.24 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  37.65 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  32.62 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  36.67 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  36.67 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  32.31 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  37.35 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  48.08 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  45.21 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  32.17 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  32.17 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  46.15 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  46.99 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  30.07 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  35.8 
 
 		 400 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  30.26 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  36.25 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  26.52 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  36.23 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  32.22 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  38.82 
 
 		 284 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  31.18 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  34.88 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  33.75 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  33 
 
 		 526 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  31.17 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  36.49 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  32.5 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  40.35 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  37.04 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  40 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  30.1 
 
 		 212 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  38.89 
 
 		 260 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  32.22 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  39.66 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  34.69 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  28.05 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  32.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  41.03 
 
 		 220 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  37.66 
 
 		 177 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  39.02 
 
 		 211 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  34.44 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.43 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  33.8 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  28.05 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  27.59 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  35.53 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 163 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  35.37 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0329  PRC-barrel  27.63 
 
 		 274 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 		 169 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>