98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5435 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  97.89 
 
 		 142 aa  276  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  94.37 
 
 		 142 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  245  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  93.66 
 
 		 142 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  73.91 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  73.19 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  57.78 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  52.55 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  51.09 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  51.41 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  55.75 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  53.64 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  53.44 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  53.28 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  51.89 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  50.94 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  41.58 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  42.86 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  41.11 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  41.11 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  36.27 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  43.06 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  37.37 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  37.37 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  31.94 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  37.08 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  37.04 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  34.12 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  38 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  39.18 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  45.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  35.87 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  34.94 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  38.1 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  33.75 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  29.76 
 
 		 285 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.33 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  33.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  30.11 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  34.88 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  28.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  32.14 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  28.57 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.16 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  30.23 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  30 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  28.24 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  32.2 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  31.25 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  29.67 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.18 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  31.4 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  32.99 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  31.87 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  31.87 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  30.39 
 
 		 399 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  45.61 
 
 		 294 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  29.11 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  45.83 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  46.34 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  42.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  34.72 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  38.82 
 
 		 389 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.24 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  29.41 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  31.31 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  38.1 
 
 		 300 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  30.58 
 
 		 161 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  29.03 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  33.72 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  31.31 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 234 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  26.44 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  35.37 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  28.74 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  34.85 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  34.85 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  26.76 
 
 		 148 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>