121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5253 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  100 
 
 
142 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 
142 aa  268  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 
142 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  94.37 
 
 
142 aa  244  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  92.96 
 
 
142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  71.74 
 
 
141 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  71.01 
 
 
141 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  55.56 
 
 
144 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  51.09 
 
 
143 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  49.64 
 
 
143 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  51.41 
 
 
146 aa  143  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  52.55 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  55.75 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  52.73 
 
 
111 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  50.94 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  49.62 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  50.78 
 
 
136 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  50.94 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  42.57 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  41.96 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  39.2 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  41.11 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  41.11 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  33.93 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  31.25 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  36.47 
 
 
400 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  38.27 
 
 
212 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  38.54 
 
 
196 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  29.51 
 
 
250 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  39.39 
 
 
284 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  34.83 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  45.76 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  32.14 
 
 
285 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  29.32 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  34.94 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  34.57 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  44.44 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  35 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.33 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  37.29 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  34.02 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  31.11 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  29.67 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  32.18 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.35 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  31.37 
 
 
399 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  29.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  29.41 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  41.51 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  37.04 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  30.23 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  32.56 
 
 
167 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  30.95 
 
 
193 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  30 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  37.5 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  34.12 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  31.36 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  29.07 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  34.72 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  31.76 
 
 
234 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  45.31 
 
 
294 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  30.12 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  29.76 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  31.46 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  25.77 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  27.59 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  36.36 
 
 
214 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  42.59 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  33.67 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 
118 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  26.37 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  27.27 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  38.64 
 
 
300 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  27.27 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  27.27 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  26.37 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  43.75 
 
 
293 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  40 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  28.23 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3528  PRC-barrel  32.89 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  27.85 
 
 
288 aa  42  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  24.74 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  24.74 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 
389 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>