96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4885 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  97.89 
 
 		 142 aa  276  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  94.37 
 
 		 142 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  94.37 
 
 		 142 aa  243  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  92.96 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  72.46 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  71.74 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  57.78 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  52.55 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  51.09 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  51.41 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  50.7 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  55.75 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  53.64 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  53.44 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  53.28 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  51.89 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  50.94 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  41.58 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  43.24 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  40 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  40 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  36.27 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  32.23 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  43.06 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  31.94 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  36.67 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  37.04 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  34.12 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  39.18 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  45.76 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  35.87 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  37.37 
 
 		 284 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  34.88 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  38.1 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  33.75 
 
 		 213 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  29.76 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  35.71 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  30.95 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  28.57 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  40.74 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  47.37 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  28.74 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  34.88 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  30.38 
 
 		 288 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  30.95 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  29.89 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  29.03 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  32.2 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  29.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  28.24 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  37.04 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  32.99 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  31.87 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  31.87 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  30.68 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  27.27 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  40.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  30.39 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  46.34 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  45.83 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  42.59 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  29.41 
 
 		 271 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  32.32 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.75 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  35.37 
 
 		 169 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  38.1 
 
 		 300 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 234 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  30.58 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  29.03 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  33.72 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  28.41 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  34.85 
 
 		 214 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>