162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0549 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  60.45 
 
 
134 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  63.39 
 
 
134 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  55.37 
 
 
137 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  42.28 
 
 
140 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  50 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  46.07 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  47.67 
 
 
163 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  36.43 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  49.33 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  37.7 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  42.57 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  42.57 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  42.57 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  41.58 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  41.58 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  41.58 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  35.2 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  41 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  43.18 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  33.6 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  38.52 
 
 
250 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  34.81 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  35.24 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  32.77 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  43.42 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  44.74 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  38.75 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  36.89 
 
 
400 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  39.51 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  32.14 
 
 
285 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  39.47 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  29.37 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  38.27 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  40 
 
 
201 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  40 
 
 
201 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  36.96 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.33 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  37.04 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  31.03 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  38.16 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  36.71 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  36.59 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  35.63 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  37.04 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  35.8 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 
155 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  35.8 
 
 
271 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  32.22 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  29.91 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  37.21 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  38.71 
 
 
179 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  34.15 
 
 
118 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  33.73 
 
 
220 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  34.57 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  29.41 
 
 
213 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  41.1 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  28.4 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  30.68 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  34.94 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  40.68 
 
 
485 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  28.41 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  36.84 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  28.41 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  30.86 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  30.08 
 
 
280 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  38.6 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  32.1 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  32.1 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  36.59 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  29.55 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  30.49 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  30.08 
 
 
280 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  40.3 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  41.43 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  32.26 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  29.2 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  27.78 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  31.65 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  28.05 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  49.06 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  26.32 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>