106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1252 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  75.7 
 
 
280 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  75.35 
 
 
280 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  47.83 
 
 
196 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  32.12 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  29.62 
 
 
300 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  31.32 
 
 
285 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  39.39 
 
 
400 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  42.59 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  42.59 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  43.96 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  40.66 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  34.67 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  40.54 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  43.9 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  33.56 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  29.41 
 
 
213 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  30.81 
 
 
169 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  44.29 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  30.3 
 
 
189 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  35.11 
 
 
148 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  39.02 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  35.42 
 
 
170 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  39.02 
 
 
98 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  43.94 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  36.89 
 
 
174 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  42.27 
 
 
167 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  45.45 
 
 
187 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  45.83 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  45.83 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1901  hypothetical protein  27.64 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  34.56 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  40.22 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  45.45 
 
 
178 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  40.91 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  27.64 
 
 
436 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  40.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  40.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  40.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  45.59 
 
 
177 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  35.09 
 
 
214 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  32 
 
 
169 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  26.53 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  26.53 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  26.53 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  26.53 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  26.53 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  26.45 
 
 
157 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  39.33 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  37.37 
 
 
142 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  25.62 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  37.35 
 
 
141 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  26.53 
 
 
280 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  35.85 
 
 
141 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  34.29 
 
 
143 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  35.79 
 
 
140 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  32.88 
 
 
134 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  26.02 
 
 
263 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  23.98 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  23.98 
 
 
322 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  23.98 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  33.71 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  46.43 
 
 
140 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  23.98 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  23.98 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  23.98 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  28.17 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  26.87 
 
 
343 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  40.32 
 
 
137 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  36.47 
 
 
140 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  34.72 
 
 
130 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  34.72 
 
 
130 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  35.11 
 
 
164 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  27.81 
 
 
140 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  30.51 
 
 
183 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  31.4 
 
 
134 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  48.84 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 
135 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  30.21 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  30.59 
 
 
157 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  36.59 
 
 
526 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2952  hypothetical protein  32.53 
 
 
331 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  32.53 
 
 
270 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  32.53 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1522  hypothetical protein  32.53 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  30.95 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  43.4 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  25.93 
 
 
485 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  34.25 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  35.82 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  31.4 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  30.12 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  34.25 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  34.38 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>