128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1648 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  75.41 
 
 
211 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  59.55 
 
 
214 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  53.14 
 
 
212 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  59.09 
 
 
214 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  59.54 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  50.63 
 
 
179 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  38.39 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  42.72 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  49.35 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  50 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  48.33 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  38.6 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  30.36 
 
 
140 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  38.04 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.17 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  36.96 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  44.26 
 
 
400 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  34.62 
 
 
250 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  43.94 
 
 
284 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  44.19 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  39.68 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  46.03 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  41.67 
 
 
140 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  35.9 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  34.62 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  46.03 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  34.85 
 
 
161 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  39.68 
 
 
115 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  49.12 
 
 
163 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  42.37 
 
 
140 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  26.52 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  41.27 
 
 
134 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  56.82 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  32.38 
 
 
137 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  33.73 
 
 
130 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  43.55 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  33.91 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  41.3 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  39.13 
 
 
175 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  43.55 
 
 
485 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  38.24 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  33.71 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  43.75 
 
 
260 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  41.51 
 
 
140 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  33.64 
 
 
169 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  34.18 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  32.73 
 
 
146 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  45 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  38.24 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  30.38 
 
 
117 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  36 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  36 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  47.73 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  32.53 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  36 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  37.7 
 
 
142 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  32.38 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 
160 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  31.52 
 
 
117 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 
130 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  36.76 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  43.75 
 
 
179 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  39.62 
 
 
135 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  38.03 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  35.71 
 
 
169 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  39.62 
 
 
141 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  38.03 
 
 
117 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  26.32 
 
 
112 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  27.85 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  33.33 
 
 
133 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  36.76 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  37.29 
 
 
526 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  32.91 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  39.62 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  35.94 
 
 
131 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  35.94 
 
 
131 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  37.84 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  37.84 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  32.29 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  35.94 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>