122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1267 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
211 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  75.41 
 
 
220 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  59.3 
 
 
214 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  54.55 
 
 
214 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  56.98 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  50 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  46.84 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  46.03 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  50.82 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  50 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  41.05 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  48.33 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  43.04 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  36.59 
 
 
140 aa  62  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 
172 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  33.93 
 
 
148 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  34.04 
 
 
140 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  45.83 
 
 
400 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  46.38 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  36.56 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  40.79 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  34.41 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  34.34 
 
 
161 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  43.64 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  47.83 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  47.83 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  49.06 
 
 
167 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  40.74 
 
 
285 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 
389 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  36.51 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  37.29 
 
 
140 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  35 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  34.12 
 
 
137 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  32.63 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  38.1 
 
 
115 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  38.1 
 
 
134 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  36.52 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  34.94 
 
 
130 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  34.94 
 
 
130 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  50 
 
 
270 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  37.1 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  50 
 
 
229 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  34.04 
 
 
134 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  40.35 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  31.17 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  54 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  34.29 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  39.06 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  35.09 
 
 
140 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  39.34 
 
 
142 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  41.38 
 
 
120 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  46.51 
 
 
293 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  50 
 
 
179 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  47.73 
 
 
210 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  35 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  32.31 
 
 
117 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  39.62 
 
 
141 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  35.29 
 
 
142 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 
142 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  34.15 
 
 
132 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 
142 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  27.65 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  41.38 
 
 
485 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  37.74 
 
 
135 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  38.6 
 
 
132 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  37.93 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  42.59 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  48.08 
 
 
120 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  36.21 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  36.21 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  37.78 
 
 
323 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  37.78 
 
 
323 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  40 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  39.06 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  37.74 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  35.38 
 
 
127 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  42.31 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  30.23 
 
 
112 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  36.67 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  40 
 
 
131 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  37.78 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  35.85 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  37.93 
 
 
120 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  45.24 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  33 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  29.61 
 
 
343 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  38.98 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  35.09 
 
 
129 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>