136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2065 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  34.63 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  31.54 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  31.54 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  31.88 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  26.32 
 
 
250 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  44.44 
 
 
400 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  41.67 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  39.58 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  41.67 
 
 
115 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  36.78 
 
 
172 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  36.08 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  35.16 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  33.01 
 
 
169 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  32.84 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  33.71 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 
167 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 
179 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  33 
 
 
137 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  36.36 
 
 
98 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  26.73 
 
 
140 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  39.34 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 
170 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  34.62 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  51.02 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  25.51 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  31.87 
 
 
98 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  40 
 
 
178 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  34.52 
 
 
174 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  35.56 
 
 
177 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  30.3 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 
134 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  32.32 
 
 
169 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  29.17 
 
 
146 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  45.28 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  30.59 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.09 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  32.14 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  32.14 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  35.9 
 
 
220 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  32.14 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  24.08 
 
 
485 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  36.67 
 
 
129 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  30.95 
 
 
157 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  31.63 
 
 
130 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
132 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  30.61 
 
 
158 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  32.56 
 
 
130 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 
141 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  37.65 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  36 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  28.74 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  29.79 
 
 
165 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  24.87 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  29.76 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  36 
 
 
229 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  40.74 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  31.33 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 
526 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  30.21 
 
 
118 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  32 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  24.35 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  27.38 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  31.11 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  31.07 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  29.76 
 
 
142 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1911  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  23.83 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  29.76 
 
 
142 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  34.72 
 
 
210 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  30.26 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 
156 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  22.89 
 
 
135 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  28.92 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  26.02 
 
 
169 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  27.59 
 
 
134 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  23.83 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  23.83 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  23.83 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  31.11 
 
 
171 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  28.07 
 
 
175 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3918  hypothetical protein  38.78 
 
 
157 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.693655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  22.16 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  32.22 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  24.86 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  23.32 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  26.8 
 
 
163 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  29.63 
 
 
179 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  26.8 
 
 
163 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  26.8 
 
 
163 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2146  hypothetical protein  33.75 
 
 
249 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.655352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  31.03 
 
 
120 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  28.28 
 
 
122 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>