32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6894 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  227  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  90.09 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  64.55 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  57.27 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  51.92 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  51.92 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  53.64 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  53.64 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  47.12 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  44.04 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  56.38 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  57.89 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  56.84 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  56.84 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  56.84 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  56.84 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  55.06 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  49.51 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  47.92 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  40.62 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  40.96 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  44.74 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  43.42 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  39.19 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  28.57 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  30.49 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  25.56 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  25.56 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  29.49 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  27.1 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  40.54 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>