124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1301 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 163 aa  336  7e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  46.59 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  47.67 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  46.59 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  45.12 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  40.57 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  40.23 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  37.14 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  38.82 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  37.65 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  33.93 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  33.93 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  33.93 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  41.67 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  43.06 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  43.06 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  38.1 
 
 		 271 aa  61.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  38.32 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  38.32 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  36.78 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  39.24 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  39.51 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  40.28 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  38.27 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  40.24 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  39.34 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  37.7 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  49.12 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  36.36 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  44.83 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  29.58 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  45 
 
 		 485 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  37.18 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  43.86 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  35.64 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1635  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  35.9 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  35.9 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  35.9 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  32.86 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.07 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  37.7 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  36.46 
 
 		 400 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  32.47 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  40.68 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  29.09 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  33.82 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  36.51 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  33.73 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  35.9 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  35.48 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0496  photosynthetic reaction center protein  29.82 
 
 		 243 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0401764  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  35.9 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  35.9 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  41.38 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  37.8 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  36.71 
 
 		 389 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  31.76 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  40.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0329  PRC-barrel  31.43 
 
 		 274 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  34.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  37.18 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  33.68 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  43.94 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  26.85 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  30.88 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  28.97 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  34.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  35.53 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  32.63 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  30.49 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  35.53 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  32.05 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3528  PRC-barrel  27.36 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  28.4 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  28.41 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  31.37 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  26.19 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  34.92 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  34.44 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  38.98 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  27.47 
 
 		 118 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  35.63 
 
 		 284 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  33.72 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>