85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1049 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 146 aa  289  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  63.56 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  62.07 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  36.3 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  42.04 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  43.62 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  40.43 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  33.11 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  38.14 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  38.3 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  38.3 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  35.16 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  29.17 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  32.09 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  28.57 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  35.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  34.83 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  31.01 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  40.91 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  34.83 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  33.71 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  31.25 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  41.82 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  37.68 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  30.07 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  30.12 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  30.72 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  41.54 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  30.86 
 
 		 293 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  44.23 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  35.51 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  36.67 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  36.67 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  37.8 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  30.86 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  39.29 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  27.16 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.93 
 
 		 187 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  29.2 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  32.56 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  30.11 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  28.92 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  29.79 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  39.29 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  29.47 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  30.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  31.62 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  34.62 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  31.25 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  30.86 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  30.86 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  31.52 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  26.32 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  33.68 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  34.88 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  35.48 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  29.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  30.23 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  29.07 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  32.94 
 
 		 131 aa  42  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  31.11 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  32.73 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  27.37 
 
 		 177 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  33.72 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  33.72 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  32.63 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  32.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  33.72 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  28.89 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  33.72 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  37.25 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  29.36 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0496  photosynthetic reaction center protein  27.96 
 
 		 243 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0401764  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  26.6 
 
 		 125 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  30 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  27.91 
 
 		 133 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  35.19 
 
 		 389 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>