121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3828 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  41.44 
 
 		 175 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  45 
 
 		 183 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  38.39 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  40.54 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  43 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  43 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  43.43 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  40.54 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  40.18 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  42 
 
 		 169 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  42.42 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  42.42 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  42.42 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  40.82 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  41.41 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  38.74 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  41 
 
 		 171 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  40.82 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  40.74 
 
 		 485 aa  87.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  43.88 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  38.33 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  38.74 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  38.74 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  37.29 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  40 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  36.94 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  36.94 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  39 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  36.04 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  37 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  37.27 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  34.23 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  32.73 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  36.27 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  38.82 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  35.87 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  27.68 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  32.22 
 
 		 526 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  27.68 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  27.68 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  36.67 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  36.67 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  32.58 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  35.63 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  24.14 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  34.88 
 
 		 172 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  32.93 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  32.18 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  32.18 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  32.04 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  32.93 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  37.93 
 
 		 389 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  36.84 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  24 
 
 		 399 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  26.67 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  26.04 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  27.84 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  27.91 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  24 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  21.82 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  35.29 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  38.89 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  32.5 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  29.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  28.05 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  28.77 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  31.82 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  25.96 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  28.24 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  28.05 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0934  PRC-barrel domain-containing protein  26 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.889607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  28.05 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  26.83 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  25 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  35.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  35.09 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3528  PRC-barrel  28.4 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  23.4 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  35.59 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  25 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  29.07 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  30.68 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>