129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2972 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  82.16 
 
 		 214 aa  316  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  82.16 
 
 		 214 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  64 
 
 		 212 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  59.55 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  59.3 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  39.82 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  45.16 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  42.57 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  50 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  32.93 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  48.61 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  53.85 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  34.41 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  37.72 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  28.1 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  46.88 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  46.15 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  44.26 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  41.67 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  54.35 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  40.28 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  31.62 
 
 		 117 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  38.2 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  43.86 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  38.81 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 		 147 aa  52.4  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  36.17 
 
 		 134 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  32.99 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  36.25 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  37.8 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  36.62 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  40.28 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  36.71 
 
 		 485 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  40.28 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  41.94 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  36.56 
 
 		 117 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  33.94 
 
 		 120 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  35.51 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  54 
 
 		 164 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  38.98 
 
 		 140 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  41.07 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  36.84 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  34.02 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  38.27 
 
 		 117 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  34.02 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  39.34 
 
 		 131 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  39.34 
 
 		 131 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  38.71 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  30.65 
 
 		 134 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  51.35 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  37.93 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  32.46 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  36 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  41.27 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  36.84 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  41.27 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6218  hypothetical protein  47.62 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  35.59 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  40.68 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  41.82 
 
 		 119 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  36.21 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  39.34 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  31.03 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  38.98 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  40.32 
 
 		 166 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  37.7 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 142 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  41.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  40 
 
 		 120 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  23.89 
 
 		 300 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  37.88 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  40.32 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  29.52 
 
 		 141 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 142 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  35.62 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  35.09 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  37.29 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  38.71 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  38.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  38.1 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  41.94 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  37.88 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  43.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>