42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2373 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  294  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  68.97 
 
 
146 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  58.27 
 
 
144 aa  173  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  57.27 
 
 
111 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  50.7 
 
 
142 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  50 
 
 
142 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  52.03 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  53.54 
 
 
142 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  53.54 
 
 
142 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  53.54 
 
 
142 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  54.55 
 
 
142 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  50.41 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  56.88 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  40.14 
 
 
143 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  49.06 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  50 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  47.54 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  42.45 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  40.71 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  31.9 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  33.98 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  33.01 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  29.08 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  28.43 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  29.76 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  31.96 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  27.84 
 
 
280 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  27.84 
 
 
280 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  25 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  26.03 
 
 
187 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  29.51 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  31.75 
 
 
179 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  28.05 
 
 
400 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  30.16 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  35.42 
 
 
250 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  34.21 
 
 
161 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 
170 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  30.23 
 
 
167 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>