43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1132 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  52.73 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  52.73 
 
 		 115 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  46.43 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  45.76 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  36.26 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  51.92 
 
 		 134 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  51.92 
 
 		 134 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  38.82 
 
 		 98 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  54 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  42.37 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  32.77 
 
 		 156 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  40.62 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  32.77 
 
 		 156 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  49.06 
 
 		 130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  29 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  33.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  43.4 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  43.4 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  46.15 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  46.15 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  33.7 
 
 		 169 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  43.94 
 
 		 142 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  38.46 
 
 		 193 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  48.15 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  43.4 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  40.74 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  48.21 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  38.18 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  38.18 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  38.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  48.21 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  48.21 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  45.61 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  39.19 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  35.96 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  45.61 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  43.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  30.43 
 
 		 140 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  35.38 
 
 		 144 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  37.66 
 
 		 141 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>