101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4656 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  95.04 
 
 
141 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  73.19 
 
 
142 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  71.74 
 
 
142 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  76.98 
 
 
142 aa  200  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  73.02 
 
 
142 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  71.43 
 
 
142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  71.43 
 
 
142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  71.43 
 
 
142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  51.75 
 
 
143 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  52.86 
 
 
143 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  55 
 
 
144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  51.88 
 
 
146 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  47.83 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  51.92 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  50 
 
 
135 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  51.89 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  47.66 
 
 
136 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  49.62 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  48.11 
 
 
140 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  37.01 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  41 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  42.16 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  41.3 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  41.3 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  40.2 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  30.71 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  35.66 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  39.51 
 
 
172 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.14 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  33.63 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  36.78 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  38.71 
 
 
400 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  35.58 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  34.34 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  35.58 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  33.86 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  33.64 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  32.14 
 
 
285 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  39.36 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  36.05 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  28.35 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  37.35 
 
 
284 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 
132 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  32.18 
 
 
193 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  34.83 
 
 
196 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  33.72 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  30.95 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  28.93 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  39.76 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  25.76 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  37.29 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.93 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  33.75 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  31.65 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  33.71 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  32.18 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  37.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  35.29 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  30.95 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  28.75 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  31.82 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  27.96 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  34.57 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  29.67 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  35.63 
 
 
234 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  38.18 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  32.91 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  32.5 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  29.41 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  37.04 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  43.33 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  34.18 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  32.18 
 
 
229 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  32.18 
 
 
270 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  35.85 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  34.57 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  32.93 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  34.04 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  35.85 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  46.03 
 
 
389 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  34.88 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5636  PRC-barrel domain protein  28.93 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  29.89 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  32.1 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  26.25 
 
 
171 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  28.75 
 
 
399 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  28.4 
 
 
118 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 
156 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 
156 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  38.46 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  28.7 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  39.53 
 
 
300 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  35.44 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  32.91 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>